For full schedule, please see http://sbbd.org.br/2019/sbbd-program/
Plenary Session 1
07/10 07:30 pm
DANIEL OLIVEIRA
When bioinformatics meets databases: achievements and lessons learned
Plenary Session 2
08/10 04:30 pm
WERNER TREPTOW
Binding of Small Ligands to Two-state Membrane Proteins
For more informations about Plenary Sessions, please see http://bsb.sbc.org.br/2019/speakers/
Minicurso (BSB): Bancos de Dados Biológicos
Tainá Raiol e Waldeyr Mendes Cordeiro da Silva
Data: Segunda-feira, 07/10/2019
Hora: 09:00 às 12:30h
Abstract
The biological data has increased in volume and diversity, becoming known as -omics (genomics, transcriptomics, epigenomics, proteomics, metabolomics, and others). Molecular Biology and Databases have played a close and cooperative relationship, which has made it possible to intensify advances in many areas. This course will provide an overview of a range of biological databases for different purposes and how to retrieve data both using the databases interfaces and some API’s. The database range includes biological sequences data, protein structure, and interaction data, and metabolic pathways. Necessary skills: Basic knowledge of Biology and computers. Desirable to maximize the experience: Python basics.
Resumo
O volume e variedade de dados biológicos oriundos de sequenciamento de alto desempenho têm aumentado significativamente. Esses dados são conhecidos como ômicos, palavra que representa o conjunto de dados genômicos, transcritômicos, epigenômicos e outros. A Biologia Molecular e os bancos de dados têm mantido um estreito e cooperativo relacionamento, o qual tem possibilitado diversos avanços em diferentes áreas. Este curso oferece uma visão geral sobre como os bancos de dados biológicos se organizam. Também mostra como buscar dados nesses bancos tanto usando interfaces Web como APIs. Os bancos de dados abordados incluem bancos de sequências biológicas, como genomas, bancos de estruturas de proteínas, de interação entre proteínas e bancos de dados de metabolismo. Pré-requisitos: Conhecimento básico em Biologia e uso de computadores. Desejável para máximo aproveitamento: Python básico.
Oral Presentation:
ST1: Technical Session 1
ST2: Technical Session 2
ST3: Technical Session 3